围绕所有生命起源地——神圣湖泊格兰雷库，阿德兹联邦与托兰王国展开了旷日持久的战争，彻底摧毁了这里的祥和与宁静。阿德兹联邦野心勃勃，妄图称霸世界。在它强大武力的攻势下，托兰王国被逼上危险境地。关键时刻，乘坐着小型飞艇的空族少女法姆（丰崎爱生配音）出现在托兰王国的公主们的面前。她是居住在靠近天空之城“卡尔塔法尔”的空族少女，天性爱好和平。法姆不由分说加入战局，而阿德兹联邦总统鲁斯吉尼亚（兴津和幸配音）...

应届大学毕业生森美咲（早见沙织饰），因为父母早年过世，现和经营面包店的姐姐和姐夫一家生活。而她现在正在美国白宫前参观旅游。一切都很正常，直到咲她被卷入一场冲突事件，所幸被解救下来，而拯救他的英雄却是个一丝不挂，全身上下只有手机一件物品的奇怪男子。而该男子不幸还失忆了，只知道他的名字是泷泽朗（木村良平饰）。而这个叫做朗的奇异男子只是所有事情的一个序幕。咲的世界观至此被颠覆，一堆疑问在她面前亟待解决。...

晴朗时节，江户川柯南（高山南配音）和毛利小五郎（小山力也配音）、小兰（山崎和佳奈配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密...